¿Qué tipo de modalidad de contrato debemos hacer a nuestros empleados? ¿Cuánto se paga de seguridad social y de IVA?

Necesito más información para poder responder a tu pregunta. Se pagará de seguridad social en función del sueldo que le pagues a cada uno de los empleados, pero aproximadamente, será un 40% de la base reguladora. Si bien, con la nueva reforma laboral, han salido muchas bonificaciones nuevas y, dependiendo de las necesidades que tenga tu empresa, deberías estudiar si te puedes acoger a alguna.
Con respecto al IVA, no tiene nada que ver con los salarios, sólo en el caso de que estés hablando de facturarle a un profesional. El IVA no se paga, se soporta o se repercute y la diferencia se devuelve a Hacienda o Hacienda nos la devuelve a nosotros. Será del 4%, del 7%, del 16% y del 33%, si bien, lo más normal es que sea del 16%.
Un saludo y espero haberte servido de ayuda.