¿Cómo imputar la seguridad social de la empresa en una baja por enfermedad?

En una baja por enfermedad, la empresa abona íntegra la seguridad social. El salario que se abona al trabajador, dependiendo del convenio laboral y de la fecha de baja tendrá una parte de salario, una parte de incapacidad que abona la empresa, y un pago delegado (lo pagas al trabajador y lo descuentas de los seguros sociales), con lo cual tienes que imputar como salario la parte que paga la empresa y como seguridad social, las cuotas empresariales. No se si me he explicado bien.