¿Qué opciones existen para vincular esta fundación a la empresa y qué pros y contras conlleva esta opción?

Con sinceridad, la consulta es tan genérica que es imposible decir nada, pues todo depende de que empresa sea, de la relación que tenga con los patronos, de si funda o no, aporta o no, a que pros y contras os referís, etc. Imposible aconsejar nada. Lo siento.

Estoy de acuerdo con el compañero en que la pregunta es poco precisa y no se si mi respuesta es lo que necesitas pero en principio si es una empresa la que quiere crear una fundación, la vinculación es directa pues esta empresa será el patrono fundador que aporte la dotación fundacional para la consecución de los fines de interés general que se establezcan en los Estatutos de la fundación. Si la empresa no busca fundar la entidad sino colaborar con ella o financiarla pueden firmarse convenios de colaboración para un fin concreto dentro del marco estatutario.

Un saludo.