¿Qué ocurre con las operaciones intracomunitarias si nuestra entidad está exenta de IVA?

Hola,

Estoy buscando información sobre el IVA en operaciones intracomunitarias y en importaciones/exportaciones, he conseguido bastante pero no me queda claro del todo.
En operaciones intracomunitarias, si tanto comprador como vendedor están inscritos en el registro de operaciones intracomunitarias, la factura debería ir sin IVA y luego el que recibe el servicio (o mercancía) debe liquidar el IVA en su país, ¿pero que ocurre si este está exento de IVA? ¿Cómo sería la contabilidad?

Por ejemplo, contratamos un servicio (sujeto a IVA) en otro país, recibimos factura sin IVA (porque ambas partes están inscritas como operadores intracomunitarios) por 1000, calculamos el 21% de esos 1000 que es lo que deberíamos pagar de IVA, ¿cómo lo declaramos? ¿en el modelo 303 aunque estemos exentos y para nosotros el IVA sea un gasto? ¿Cómo sería el asiento contable de esta operación, 210 como mas gasto contra la 475 de Hacienda acreedora?

Gracias.