¿Qué obligación existe por parte de una usuaria de devolver parte de una subvención que el Ayuntamiento le concedió por error?

Si, como supongo, hace poco tiempo que se cometió el error, es claro que tiene obligación de devolver la subvención, haya acertado o no el Ayuntamiento en invocar la causa del art. 37. Si le deniegan cualquier ayuda a la que tenga derecho, cuando quiera reclamar judicialmente el Ayuntamiento puede poner en marcha el expediente de reclamación y compensar. Por otra parte, con sus ingresos no pueden embargarle cantidad alguna para obligarle a que la devuelva.

En principio no le queda más remedio que devolver el importerecibido que suponga un exceso a lo que debía haber recibido.
Al no haber transcurrido el tiempo de prescripción, la administración que concedió la subvención está plenamente legitimada para reclamar ese importe, y también para no otorgar ninguna otra cantidad como subvención hasta el momento en que la prestataria la adquiera. Sucede de manera similar a si tuviera deudas con hacienda, o multas.
Un saludo, y espero haber sido de ayuda

El artículo 36.4 de la Ley General de Subvenciones que usted cita, dispone que la declaración judicial o administrativa de nulidad o anulación llevará consigo la obligación de devolver las cantidades percibidas.-
Si no ha transcurrido el plazo de prescripción de 4 años que establece el artículo 39, viene obligado al reintegro de la subvención.-

Esta respuesta no es vinculante.-