¿Por donde empezamos a actualizar una asociación que no está al día de sus obligaciones?

¡Puf! ¡menudo marrón!
Por experiencia propia, dependerá de como lo tomen los del Registro de asociaciones en donde esté inscrita. Es allí donde debereis actualizar los datos.
Por casualidad están localizables los últimos presidente/a y secretario/a. Si así fuese se trataría de convocar una asamblea general comunicada previamente a los socios disponibles, y designar una Jun ta Gestora, con al menos 3 personas: presidencia, secretaria y tesorería, y un docimilio social.

Si no estuvisen disponibles los últimos cargos, se haría una autoconvocatoria de Asamblea General de personas socias o que desean ser socias, designar una Junta Gestora y un domicilio social.
En cualquiera de los dos casos, lo primero es comunicar de inmediato (<30 días) al registro el nombramiento de la Junta Gestora mediante certificado del nuevo Secretario/a, fijando un docimilio social para notificaciones. Esperar a ver que dicen, por si ponen algún problema,o en todo caso hablar con ellos al llevarles el escrito notificando jnueva Gestora ty domicilio
A partir de ahí, ir actualizando todo: el CIF se supone que ya existe y no ha cambiado. Ver si hay cuentas bancarias abiertas, libros de actas, etc.
Sería interesante disponer de toda la documebntación preexistente