¿En qué obligaciones fiscales incurre nuestra asociación al crear una ludoteca?

Tu planteamiento es lógico, pero no estoy seguro que sea el más correcto:
¿Esa actividad forma parte del objeto social de la ONG?. Piensa que podría entrar en conflicto con otros negocios similares que, aunque tengan ánimo de lucro, son tan legítimos como vosotros y podéis tener dificultades.
Los trámites son los típicos: licencia fiscal, de apertura, los seguros, etc., En cuanto a la exención de IVA, sabrás que se aplica únicamente al que vosotros facturais, por contra no podeis desgravaros del que pagais.
Si fuera parte de vuestro objeto social, el dinero que se cobra a los padres, podría considerarse una participación de los beneficiarios en los gastos de la actividad.
Si el servicio es atendido por voluntarios, atención porque no hay remuneración y son muy importantes los seguros, pues imagina que a un niño le sucede algo…; eso está regulado, tanto por responsabilidad civil, como el específico que corresponda a la actividad.
Por último, me parece entender que el dinero obtenido se destinará a cubrir los gastos y a sufragar otras actividades de la asociación. En este punto hablamos de algo diferente, pues lo que hacéis es crear una actividad comercial cuyos beneficios se destinan a atender necesidades sociales y ya todo es diferente.