En caso de arrendamiento de nuestra sede a una asociación ¿Se debe efectuar la retención legal del IRPF?

Hola:
El IRPF se aplica si interviene una persona física. Sobre el IVA, si el local es para vuestras actividades, tendréis que pagarlo y sin posibilidad de deducirlo y el arrendador, la otra asociación, lo cobrará y tendrá que liquidarlo trimestralmente.
El alquiler del local en calidad de inquilinos no es una actividad ajena a la de la asociación, es un gasto necesario para el funcionamiento. Sí lo sería si se dedicara a un fin diferente, p.e. se tratara de una tienda que gestionáis vosotros.