¿Como podemos aumentar el salario por un periodo de tres meses sin ser horas extras?

Muchas gracias a todos por el gran apoyo que nos dais cada dia.
Para ANDECO ha sido una gran ayuda leeros y preguntaros nuestras dudas en tantos temas que son para nosotros completamente nuevos y que la propia administración a veces desconoce.

Necesitamos resolver una duda sobre contratación. Tenemos un empleado contratado a jornada completa, es programador informático, discapacitado y su contrato es indefinido. Acabamos de recibir una subvención para la página web y nuestro informático tendrá por 3 meses una responsabilidad mayor en el desempeño de sus tareas, la cual requiere un aumento de sueldo por este periodo de tiempo. No sabemos como hacer este cambio, si tenemos que realizarle un nuevo contrato o incrementar el salario por tres meses, ¿es esto posible?, en caso de serlo ¿en concepto de que?. Para reflejar esto en el TC2 del red directo, ¿cual sería el proceso? Tenemos que justificar este incremento de salario en los TC2 y en las nóminas.

Gracias.